Flying WitchComédia, Magia, Slice of Life, Sobrenatural, ShounenEps. 21Na tradição das bruxas, quando um praticante completa 15 anos, ele deve se tornar independente e sair de casa para estudar bruxaria. Makoto Kowata é uma bruxa aprendiz que deixa a casa de seus pais em Yokohama em busca de conhecimento e treinamento. Junto com seu companheiro Chito, um familiar gato preto, eles embarcam em uma jornada para Aomori, uma região favorecida pelas bruxas devido à sua abundância de natureza e afinidade com a magia. Eles começam sua nova vida morando com os primos em segundo grau de Makoto, Kei Kuramoto e sua irmãzinha Chinatsu.
Enquanto Makoto pode parecer estar frequentando o ensino médio como qualquer outro adolescente, seu envolvimento caprichoso e excêntrico com bruxaria a diferencia dos outros de sua idade. Desde seu encontro com uma cartomante canina antropomórfica até o treinamento mágico peculiar que ela recebe de sua irmã mais velha Akane, a vida cotidiana pacífica de Makoto é repleta de idiossincrasias de feitiçaria que ela compartilha com seus amigos e familiares.